71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1402 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  100 
 
 
394 aa  825    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  69.64 
 
 
395 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.43 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  26.26 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
298 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  22.03 
 
 
401 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  28.07 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.94 
 
 
326 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  24.92 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
323 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
323 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.01 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.67 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  28.33 
 
 
229 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  27.87 
 
 
229 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  28.89 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  28.89 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  28.89 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  28.89 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.94 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  28.96 
 
 
229 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  27.32 
 
 
229 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  23.42 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  27.37 
 
 
229 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
194 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.91 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
228 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  27.37 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.25 
 
 
336 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  23.69 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.6 
 
 
275 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.11 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  23.49 
 
 
401 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
681 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  24.16 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
996 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 
217 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.38 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  23.01 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.25 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.44 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
513 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  21.7 
 
 
625 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.93 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  22.71 
 
 
414 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  27.97 
 
 
241 aa  46.2  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  27.61 
 
 
200 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.76 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.29 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.37 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.97 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  22.16 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  26.45 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.72 
 
 
298 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  23.37 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
1314 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  29.36 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
274 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  24.08 
 
 
247 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  21.2 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  32.53 
 
 
312 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  23.87 
 
 
287 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.75 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.02 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
352 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  19.76 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>