127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5655 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 		 392 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  26.14 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  43.96 
 
 		 305 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  21.74 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  20.22 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  22.69 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  22.61 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  23.85 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  24.73 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  23.02 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  22.93 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  24.25 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  22.43 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  22.55 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  22.91 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  28.16 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  23.31 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  20.38 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  23.64 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.48 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  26.56 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  21.19 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  26.91 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  24.75 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  24.89 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  27.31 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  23.12 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  26.53 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  20.74 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  27.07 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  27.64 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  24.25 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  26.14 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  24.79 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  21.98 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  21.41 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  22.87 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  23.37 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  22.43 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 286 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  23.16 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  23.85 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.54 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  30 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  22.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  20.53 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  23 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  22.04 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  21.55 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  20.75 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  19.94 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  24.14 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 607 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.86 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.67 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  23.92 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  30.68 
 
 		 241 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.64 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  22.76 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  25.77 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  45.45 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  33.73 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26.14 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  23.64 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  18.38 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  23.65 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.74 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  20.1 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>