92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0067 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  100 
 
 
413 aa  838    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  67.81 
 
 
411 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  57.57 
 
 
416 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  50.49 
 
 
433 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50.88 
 
 
420 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  50.24 
 
 
433 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  48.39 
 
 
411 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  48.63 
 
 
412 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  47 
 
 
431 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  49.87 
 
 
400 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  43.32 
 
 
413 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  42.82 
 
 
413 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  45.91 
 
 
411 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  50.13 
 
 
410 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  46.91 
 
 
408 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  47.25 
 
 
420 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  47.16 
 
 
409 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  44.8 
 
 
407 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  43.14 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  44.31 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  45.66 
 
 
409 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  46.04 
 
 
407 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  42.14 
 
 
411 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  44.03 
 
 
409 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  45.1 
 
 
406 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  43.53 
 
 
409 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  43.36 
 
 
407 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  42.82 
 
 
407 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  42.64 
 
 
407 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  43.36 
 
 
407 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  43.11 
 
 
407 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  48.77 
 
 
373 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  45.83 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  41.34 
 
 
402 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  43.78 
 
 
413 aa  316  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.18 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  39.95 
 
 
410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  38.06 
 
 
409 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  40.25 
 
 
415 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41.5 
 
 
410 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  41.41 
 
 
427 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.16 
 
 
410 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.99 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  31.94 
 
 
418 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  36.54 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  34.16 
 
 
400 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  33.91 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.25 
 
 
421 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  36.67 
 
 
405 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  36.12 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.5 
 
 
408 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  33.66 
 
 
408 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  30.17 
 
 
436 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.1 
 
 
413 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  27.38 
 
 
409 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.09 
 
 
409 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.68 
 
 
416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  27.4 
 
 
412 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.4 
 
 
412 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  27.43 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  27.39 
 
 
396 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.57 
 
 
396 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.82 
 
 
376 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  27.25 
 
 
402 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.86 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27.01 
 
 
817 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  28.51 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.71 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.43 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  27.27 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.85 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  23.83 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.18 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  24.35 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.64 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.38 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.71 
 
 
305 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.27 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.45 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.08 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  23.28 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.32 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  23.84 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  21.88 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  20.63 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.49 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  22.53 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.52 
 
 
401 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>