110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3716 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  76.9 
 
 		 408 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  100 
 
 		 407 aa  837    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  62.12 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  57.99 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  64.42 
 
 		 373 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  54.79 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  58.19 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  54.55 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  52.58 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  52.12 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  52.58 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  53.81 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  52.57 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  56.02 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  51.48 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  52.22 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  48.18 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  51.23 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  52.84 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  47.94 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  50.73 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  49.75 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  49.26 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  46.17 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  44.94 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  44.94 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  47.17 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  45.81 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  46.42 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  46.17 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  43.95 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  46.04 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  45.43 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  45.19 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  47.32 
 
 		 413 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.33 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.38 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  41.91 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  43.94 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  43.72 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  42.72 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  42.01 
 
 		 410 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  37.8 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.96 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.65 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  33.74 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  35.05 
 
 		 419 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.27 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  33.83 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.34 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  31.05 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  31.05 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.41 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.9 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  25.37 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.24 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  30.37 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.72 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.94 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.94 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  32.64 
 
 		 359 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  26.56 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.56 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.1 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  28.94 
 
 		 817 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.37 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.48 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.77 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.47 
 
 		 178 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.93 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.58 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.39 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  22.47 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.98 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.62 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  22.57 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  20.69 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19.41 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.67 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 1177 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 1177 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 513 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  30.69 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.84 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.83 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  19.7 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.16 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.23 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  20.5 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 226 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  24.54 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>