109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3938 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  100 
 
 		 444 aa  895    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  83.74 
 
 		 427 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  60.05 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  55.15 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  49.39 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  47.54 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  52.1 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  51.65 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  46.44 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  45.21 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  47.45 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  43.34 
 
 		 420 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  43.03 
 
 		 413 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  42.2 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  42.79 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  46.42 
 
 		 420 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  41.46 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  43.98 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  43.31 
 
 		 408 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  43.1 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  44.42 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  46.45 
 
 		 409 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  44.55 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  45.97 
 
 		 409 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  42.47 
 
 		 411 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  44.33 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  43.38 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  42.49 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  43.18 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  42.72 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  45.04 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  43.81 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  41.01 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  41.98 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  38.57 
 
 		 411 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  44.85 
 
 		 438 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  39.07 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  40.15 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  40.64 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  39.9 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  39.55 
 
 		 419 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  39.9 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  43.99 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  38.34 
 
 		 402 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  38.4 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  39.25 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  38 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  37.5 
 
 		 406 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.75 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.68 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.51 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  37.84 
 
 		 400 aa  217  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.41 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.27 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.67 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.35 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.8 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  29.1 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  27.05 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.05 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.58 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27.13 
 
 		 817 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  28.27 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.29 
 
 		 178 aa  90.1  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.43 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.81 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.62 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.46 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.94 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.03 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.54 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.3 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  20.94 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.21 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.59 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  22.45 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.12 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.99 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  18.35 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.39 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.89 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.09 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  21.24 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.16 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  29.45 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.32 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.48 
 
 		 277 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  21.18 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  29.87 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  24.87 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  21.14 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  24.7 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25.16 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>