106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4219 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  100 
 
 		 412 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  60.1 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  54.85 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  54.37 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  54.3 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  54.23 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  53.27 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  52.24 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  55.53 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  52.87 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  53.62 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  53.87 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  52.62 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  52.12 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  52.87 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  54.48 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  50.25 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  50.62 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  50.12 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  52.12 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  56.49 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  50.37 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  48.29 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  49.75 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  48.88 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  48.63 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  48.9 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  48.9 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  48.9 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  47.54 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  49.14 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  48.02 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  50 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  48.02 
 
 		 413 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  46.44 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  46.39 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  46.06 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  47.04 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  44.84 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  41.32 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  45.09 
 
 		 410 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  42.05 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  38.92 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  33.17 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  34.94 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.12 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.32 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  36.05 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.31 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  32.92 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  33.58 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  34.58 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  34.58 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  29.83 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.32 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.47 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.17 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  29.92 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.92 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  31.08 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.5 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.49 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  37.2 
 
 		 178 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  23.22 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  24.56 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  26.18 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  26.76 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  26.56 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.16 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.65 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  28.77 
 
 		 817 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  23.88 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.19 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  21.6 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  25.7 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  22.99 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  23.77 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  22.54 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  22.85 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  19.55 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  22.64 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.83 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.78 
 
 		 303 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.98 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.79 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  23.43 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.73 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  23.9 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.6 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.96 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.1 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  26.6 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  28.07 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>