102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3959 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  100 
 
 		 414 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  63.09 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  62.59 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  61.81 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  43.15 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  28.08 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  27.18 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  28.57 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  26.84 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.7 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  26.01 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.77 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  25.73 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.64 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  23.75 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  26.59 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  21.93 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  25 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  29.09 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  22.56 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  22.98 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  22.31 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  22.12 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  24.06 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  25.18 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  23.53 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  21.6 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  28.45 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  23.06 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  22.98 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  21.89 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  20.7 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  20.7 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  21.64 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  20.95 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  22.64 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  25.41 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  20.7 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  21.13 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.02 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  23.53 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  22.61 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  20.66 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  21.28 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  23.59 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  24.06 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  26.38 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  25 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  23.89 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  25.37 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  25.07 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  26.17 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  29.41 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  25.32 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  20.99 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  20.84 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  22.02 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  22.94 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  23.38 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.11 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.64 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  28.21 
 
 		 276 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  22.06 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  22.79 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  19.73 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  22.15 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  18.39 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.01 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.47 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  19.06 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  24.69 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  18.86 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  25.22 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.59 
 
 		 178 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.99 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 1340 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.91 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  24.08 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  22.08 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  25.39 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>