104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4225 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  100 
 
 
407 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  39.26 
 
 
409 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  37.44 
 
 
433 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  38.92 
 
 
412 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  37.93 
 
 
420 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  39.41 
 
 
419 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  37.19 
 
 
433 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  35.78 
 
 
418 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  42.33 
 
 
410 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  40.39 
 
 
410 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  39.07 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.12 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  39.41 
 
 
415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  36.91 
 
 
409 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  36.12 
 
 
431 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  35.4 
 
 
413 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  36.66 
 
 
420 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.52 
 
 
421 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  35.15 
 
 
413 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  39.75 
 
 
427 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  36.16 
 
 
415 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  36.16 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  35.02 
 
 
411 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  36.16 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  36.59 
 
 
416 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  33.83 
 
 
407 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  36.25 
 
 
408 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  34.99 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  34.74 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  37.76 
 
 
410 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  34.41 
 
 
407 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.81 
 
 
408 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  33.25 
 
 
408 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  34.75 
 
 
411 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  34.24 
 
 
411 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  35.56 
 
 
402 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  35.22 
 
 
409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.25 
 
 
406 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  35.22 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  33.99 
 
 
407 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  34.96 
 
 
407 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  33.91 
 
 
405 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  33.76 
 
 
400 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  35.22 
 
 
407 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  35.22 
 
 
407 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  35.66 
 
 
413 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  33.08 
 
 
406 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  32.51 
 
 
408 aa  242  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  34.89 
 
 
438 aa  239  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  34.88 
 
 
373 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  35.07 
 
 
400 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  35.07 
 
 
400 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.71 
 
 
409 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  30.71 
 
 
409 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  29.58 
 
 
436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  32.72 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30 
 
 
412 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  29.19 
 
 
416 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  30 
 
 
412 aa  193  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  28.99 
 
 
400 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  36.2 
 
 
178 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  24.37 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.33 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.79 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  25.37 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.15 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  23.23 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.59 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.66 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  23.31 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  21.59 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  23.8 
 
 
817 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.54 
 
 
421 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  20.55 
 
 
383 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.94 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  22.45 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.26 
 
 
277 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.21 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.71 
 
 
305 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  21.49 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  21.49 
 
 
361 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.91 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.33 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  24.79 
 
 
285 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  24.32 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 
1177 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 
1177 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
239 aa  46.6  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.75 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.14 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.41 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.48 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  25.36 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.21 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
282 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.53 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.93 
 
 
229 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  22.73 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>