84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0965 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  100 
 
 
217 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  50.48 
 
 
222 aa  235  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  45.71 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  46.63 
 
 
212 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  47.12 
 
 
212 aa  214  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  52.17 
 
 
215 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  50.48 
 
 
215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  50.24 
 
 
257 aa  201  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  46.7 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  47.85 
 
 
230 aa  197  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  43.66 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  41.9 
 
 
214 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  45.71 
 
 
223 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  44.56 
 
 
215 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  39.05 
 
 
223 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  39.44 
 
 
213 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
212 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  40.28 
 
 
217 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  40.1 
 
 
211 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  40.78 
 
 
212 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
212 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
212 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
212 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  39.23 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 
217 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
214 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  39.64 
 
 
213 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  33.85 
 
 
214 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.34 
 
 
214 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  32.86 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  33.02 
 
 
212 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  33.02 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  28.21 
 
 
214 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  31.78 
 
 
212 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  29.38 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  30.81 
 
 
222 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  28.5 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  27.62 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.74 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
248 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  25.12 
 
 
308 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
336 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  30.08 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  27.7 
 
 
304 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.69 
 
 
267 aa  48.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.26 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  28.92 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
310 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.55 
 
 
300 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  24.42 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.82 
 
 
414 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
257 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 
391 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 
391 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.25 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  26.01 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.96 
 
 
406 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1757  hypothetical protein  32.43 
 
 
601 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.309214  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  25.1 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  35.62 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
1523 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.72 
 
 
1046 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
330 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.22 
 
 
298 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  39.68 
 
 
266 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>