79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3380 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  100 
 
 
391 aa  818    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  28.46 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.03 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.98 
 
 
383 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  27.86 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.36 
 
 
421 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  23.21 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  25.83 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.1 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  21.2 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
346 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
234 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  23.67 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  22.55 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  21.11 
 
 
406 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  27.23 
 
 
391 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  23.36 
 
 
420 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  25.58 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  24.2 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.37 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  25.58 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
996 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  26.9 
 
 
574 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  20.28 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.27 
 
 
277 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  24.27 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  30.07 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  24.27 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.15 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  30.07 
 
 
407 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  22.47 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  23.61 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.74 
 
 
1046 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  20.75 
 
 
303 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  30.07 
 
 
407 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  25.5 
 
 
272 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.12 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  23.5 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.65 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
214 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  29.37 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
237 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.12 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  25.79 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  24.83 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
1340 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  22.91 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  28.87 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
246 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  21.66 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  25 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
274 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  24.53 
 
 
272 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
1094 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  25.98 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.05 
 
 
252 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  31.17 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.34 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.31 
 
 
250 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 
334 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  31.65 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  30.97 
 
 
300 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.21 
 
 
252 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
634 aa  43.1  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.09 
 
 
252 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>