102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2386 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  100 
 
 		 410 aa  836    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  93.17 
 
 		 410 aa  726    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  65.66 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  54.84 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  51.36 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  51.86 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  43.96 
 
 		 415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  51.01 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  44.64 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  44.67 
 
 		 411 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  45.95 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  43.84 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  43.7 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  41.54 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  41.98 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  44.25 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  41.23 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  41.23 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  41.79 
 
 		 413 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  41.28 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  40.15 
 
 		 408 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  43.14 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  40.99 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  42.08 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  42.12 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  41.33 
 
 		 400 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  42.26 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  40.55 
 
 		 406 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  41.04 
 
 		 413 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.31 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  40.3 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  37.97 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  41.01 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  40.4 
 
 		 409 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  41.34 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  40.4 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  40.59 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  38.71 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  38.71 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  43.17 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  38.71 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  38.46 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  39.55 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  36.65 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  37.12 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  36.16 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.74 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.65 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  32.84 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  33.5 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  33.5 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  29.37 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  34.48 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  29.57 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  28.33 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.33 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.19 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.89 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.9 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.92 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  34.36 
 
 		 178 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.62 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  26.74 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  25.45 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.7 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.03 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  27.73 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.32 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  25.19 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  29.81 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.7 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  25.89 
 
 		 817 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  21.26 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  23.26 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.83 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.54 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.28 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.5 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  21.01 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  27.45 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  29.21 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 1177 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 1177 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.28 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  22.1 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  17.98 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.47 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.55 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  23.78 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 222 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>