109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3318 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  100 
 
 		 383 aa  783    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.46 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.14 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 1046 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  25.98 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  21.58 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.15 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  25 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.68 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.56 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.21 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  27.55 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  26.65 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.14 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  25.2 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  29.61 
 
 		 574 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.11 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 513 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  20.7 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.4 
 
 		 672 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.07 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  21.95 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  21.6 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  23.23 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  23.23 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.73 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 275 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  23.71 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.63 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  24.61 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.22 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  26.79 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  23.32 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  23.59 
 
 		 572 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  22.78 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  24.03 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 1340 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.85 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  25.73 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.32 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  24.44 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  24.17 
 
 		 430 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  23.1 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.02 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  22.9 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  23.63 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 232 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.8 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.13 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  21.48 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.54 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.17 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  22.29 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  24.02 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  22.29 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  22.83 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.83 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  28.95 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  23.78 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.25 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  22.4 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  22.92 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.04 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.9 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  22.68 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  21.78 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 1162 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  22.41 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>