191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2391 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  100 
 
 		 406 aa  843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  68.64 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  43.46 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  46.82 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  44.76 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  40.1 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  44.11 
 
 		 414 aa  315  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  43.83 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  39.75 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  39.85 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  39.11 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  32.98 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  28.76 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  26.38 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  28 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  28 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  26.67 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  26.21 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  25.33 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  25.57 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  26.8 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  28.02 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  28.43 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  21.78 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  25.25 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  24.62 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  28.68 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  26.97 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  26.18 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  28.65 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  25 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  26.4 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  25.9 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  26.96 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  25.32 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  28.08 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  25.06 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  25.06 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  24.27 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  25.56 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  25.14 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  24.94 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  25 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  25.31 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  24.42 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  26.95 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  25.06 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  24.62 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  24.69 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  25.68 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  25.06 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  30.2 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  24.28 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  24.88 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  26.46 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  25.91 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.69 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  28.73 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  21.53 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  25.57 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  25.9 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  25.25 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  26.14 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  21.53 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  24.81 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  24.18 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  25 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  21.85 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 1046 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  23.93 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  19.75 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.16 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  27.66 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  38.64 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  26.52 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  20.85 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  22.14 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.4 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  22.14 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  24.49 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  21.91 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  21 
 
 		 341 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  18.16 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 306 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.18 
 
 		 308 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 351 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  20.96 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>