104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3092 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  93.5 
 
 		 410 aa  730    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  100 
 
 		 410 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  64.68 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  54.84 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  52.1 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  51.86 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  47.54 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  51.39 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  43.61 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  45.43 
 
 		 431 aa  359  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  45.3 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  44.09 
 
 		 411 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  43.39 
 
 		 407 aa  345  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  41.13 
 
 		 408 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  42.22 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  41.98 
 
 		 420 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  41.77 
 
 		 413 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  44.5 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  41.48 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  41.27 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  42.96 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  41.73 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  42.35 
 
 		 400 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  41.98 
 
 		 420 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  40.15 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  42.22 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  41.5 
 
 		 413 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  42.65 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  41.83 
 
 		 409 aa  305  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  37.99 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  40 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  41.77 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  41 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  39.85 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.42 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  39.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  40.75 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  40.69 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  38.48 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  38.48 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  38.48 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  43.72 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  40.2 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  38.35 
 
 		 419 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  37.04 
 
 		 408 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  37.63 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  36.23 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  35.57 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  36.76 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  32.68 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  33.75 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  33.75 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  29.62 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  34.48 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  30.05 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  28.57 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.57 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.61 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.47 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.64 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  33.74 
 
 		 178 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  27.02 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.19 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  24.03 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.63 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.62 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.48 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.34 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  27 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  29.95 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  23.45 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.4 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  24.72 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.92 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  23.01 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.17 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.09 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.13 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.83 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.07 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.02 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  21.01 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  23.61 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.55 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.21 
 
 		 285 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  29.21 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.46 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  18.4 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  23.01 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  28.85 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 222 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>