104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0790 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  83.89 
 
 
444 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  100 
 
 
427 aa  863    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  56.62 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  53.9 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  46.06 
 
 
409 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  47.42 
 
 
411 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  51.36 
 
 
410 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  51.01 
 
 
410 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  44.47 
 
 
412 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  44.25 
 
 
413 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  44.23 
 
 
415 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  44.01 
 
 
413 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  45.83 
 
 
411 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  41.4 
 
 
420 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  45.19 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  43.49 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  41.09 
 
 
433 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  43.32 
 
 
408 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  39.95 
 
 
433 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  44.23 
 
 
408 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  43.84 
 
 
409 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  44.09 
 
 
407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  43.84 
 
 
409 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  43.39 
 
 
407 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  44.55 
 
 
416 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  43.26 
 
 
410 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  42.61 
 
 
409 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  41.95 
 
 
413 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  40.49 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  42.86 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  41.77 
 
 
400 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  41.65 
 
 
413 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  39.51 
 
 
407 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  40.15 
 
 
419 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  42.29 
 
 
407 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  41.29 
 
 
407 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  42.75 
 
 
409 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  41.13 
 
 
407 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  41.13 
 
 
407 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  37.93 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  40.89 
 
 
407 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  40.23 
 
 
438 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  37.63 
 
 
402 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  37.93 
 
 
408 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  41.58 
 
 
373 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  37.53 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  35.48 
 
 
405 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.83 
 
 
406 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.76 
 
 
421 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  36.92 
 
 
400 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  31.42 
 
 
400 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  31.17 
 
 
400 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.7 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.11 
 
 
416 aa  186  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  32.04 
 
 
413 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  29.83 
 
 
409 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  28.57 
 
 
436 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.65 
 
 
409 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.61 
 
 
412 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  28.61 
 
 
412 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.87 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  26.75 
 
 
817 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.26 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.57 
 
 
406 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  24.87 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  34.56 
 
 
178 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.51 
 
 
390 aa  87  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  27.39 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.81 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  20.15 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.08 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  22.79 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  23.54 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.16 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.5 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  23.2 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.01 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  19.42 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.61 
 
 
303 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.3 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  20.48 
 
 
379 aa  57  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.49 
 
 
383 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  30.2 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  21.69 
 
 
430 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.62 
 
 
240 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  20 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.25 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  22.96 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.88 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  33 
 
 
303 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  22.65 
 
 
401 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.28 
 
 
415 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.57 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.91 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.54 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>