38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2639 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2639  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  51.63 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0609  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 221 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0931  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 1032 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  30.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  41.74 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  27.94 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 1162 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 238 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1164  methyltransferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  27.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 		 252 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.32 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>