More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4583 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.39 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.38 
 
 
200 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.28 
 
 
233 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  35.47 
 
 
198 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
211 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  35.61 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  33.99 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  31.22 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  32.35 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  33.5 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.3 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
309 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  32.5 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.75 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.23 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
307 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 
307 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 
239 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
348 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.31 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.87 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  24.56 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  29.66 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  31.03 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.32 
 
 
291 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  35.59 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
329 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.58 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.87 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.33 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  24.68 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  29.75 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.62 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.58 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
341 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.82 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>