More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3215 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  100 
 
 		 320 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.86 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.51 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.29 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  32.68 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.86 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.55 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.06 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.41 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.93 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.19 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  29.75 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.63 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.1 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  24.66 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.51 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.22 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  29.69 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08050  methyltransferase family protein  27.83 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  hitchhiker  0.0000000452502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  27.94 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.53 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 204 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  28.12 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 204 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  29.71 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 710 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 202 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.24 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 204 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1508  hypothetical protein  37.37 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  29.63 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2219  Methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.25 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.37 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>