More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0574 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  100 
 
 
291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.26 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.58 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.85 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.54 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.97 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.93 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.58 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.9 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  32.88 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.25 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
225 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.55 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  42.86 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.74 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.63 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.56 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.12 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.94 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  39.36 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  38.6 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.26 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.88 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
238 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  35 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
265 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.19 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.19 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.19 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.13 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.57 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.19 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.19 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.79 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.23 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.14 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  27.66 
 
 
194 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.23 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.08 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
207 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
254 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.89 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40 
 
 
244 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.78 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.88 
 
 
249 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.26 
 
 
249 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>