223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2187 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  100 
 
 		 330 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  86.06 
 
 		 331 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  86.06 
 
 		 331 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  86.06 
 
 		 331 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  86.06 
 
 		 331 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  85.71 
 
 		 330 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  85.15 
 
 		 330 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  84.85 
 
 		 330 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  85.15 
 
 		 330 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  85.76 
 
 		 332 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  84.55 
 
 		 330 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  83.33 
 
 		 330 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  83.33 
 
 		 330 aa  584  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  83.03 
 
 		 330 aa  578  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  81.52 
 
 		 330 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  78.96 
 
 		 330 aa  549  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  65.53 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  61.49 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  61.49 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  62.54 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  61.49 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  61.49 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  61.8 
 
 		 323 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  61.49 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  61.49 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  61.8 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  61.18 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  63.16 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  61.18 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  60.56 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  60.56 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  60.56 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  60.56 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  62.23 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  60.25 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  59.63 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  60.37 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  59.01 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  58.39 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  58.02 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  58.7 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  58.07 
 
 		 323 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  58.07 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  58.07 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  57.76 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  58.07 
 
 		 322 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  59.32 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  56.88 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  54.32 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  51.39 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  50.31 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  50.93 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  50.31 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  51.39 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  51.85 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  50.77 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  52.47 
 
 		 319 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  50.16 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  50.93 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  51.08 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  50.77 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  50.62 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  52.16 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  50.46 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  50.46 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  51.84 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  50 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  50.16 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  49.69 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  49.39 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  48.36 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  54.66 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  47.75 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  40.49 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  41.35 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  38.79 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  38.38 
 
 		 282 aa  203  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  39.25 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  40.16 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  36.74 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  36.74 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  35.36 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  39.91 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  29.12 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.54 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>