103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2992 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  39.63 
 
 
222 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.66 
 
 
345 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  26.99 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
397 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  25.17 
 
 
1124 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.56 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
263 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
303 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
317 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  26.54 
 
 
280 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
281 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  35.29 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  29.29 
 
 
249 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
352 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.96 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35.71 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
810 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  21.37 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.02 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.89 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
259 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  40 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.11 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.02 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
208 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.64 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
266 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.08 
 
 
255 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.67 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  35.71 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
331 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.38 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
299 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
974 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3274  hypothetical protein  24.52 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  27.37 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.07 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.54 
 
 
280 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  25.38 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  34.19 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
506 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
333 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  32.47 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
457 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  43.14 
 
 
678 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  21.48 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  21.5 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  26.23 
 
 
245 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.52 
 
 
342 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  30.28 
 
 
297 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
206 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
596 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
273 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.53 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  39.45 
 
 
409 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  40 
 
 
274 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.3 
 
 
239 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.67 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  33.04 
 
 
244 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  24.52 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  35.25 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>