160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1721 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  86.64 
 
 
277 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  46.15 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  45.79 
 
 
274 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  45.79 
 
 
274 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  45.79 
 
 
274 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  45.79 
 
 
274 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  45.42 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  45.42 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0334  methyltransferase type 11  43.91 
 
 
272 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.530164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2600  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
265 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
266 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
266 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.98 
 
 
260 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.3 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.9 
 
 
220 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.37 
 
 
245 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
477 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 
234 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.22 
 
 
229 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2192  hypothetical protein  41.27 
 
 
65 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.53 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
218 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.08 
 
 
232 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.81 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.72 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.34 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.34 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.39 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  25.47 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.85 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.96 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.99 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.27 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.07 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.97 
 
 
232 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.21 
 
 
232 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.39 
 
 
237 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.39 
 
 
237 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  26.23 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
231 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.67 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  24.84 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.33 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
225 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.33 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.69 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
262 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  30.33 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  24.84 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
218 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  21.68 
 
 
209 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
241 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.22 
 
 
204 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.52 
 
 
232 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30 
 
 
217 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.31 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  24.84 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.14 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.76 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  31.07 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.45 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.48 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.37 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.19 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.19 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  23.95 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
429 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>