222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2515 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  86.64 
 
 
277 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  45.96 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  45.59 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  45.59 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  45.59 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  45.59 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  46.04 
 
 
297 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  46.04 
 
 
297 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0334  methyltransferase type 11  43.22 
 
 
272 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.530164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2600  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31 
 
 
260 aa  99  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.28 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.78 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.68 
 
 
328 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 
335 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.86 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.76 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.86 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.41 
 
 
252 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.57 
 
 
236 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  28 
 
 
259 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
232 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  28 
 
 
259 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.4 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.33 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2192  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.76 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.93 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  26.71 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.19 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.85 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.17 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.55 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 
342 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.17 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.94 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.9 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  27.05 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 
232 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.79 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.89 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
218 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
206 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
349 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
354 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.55 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.15 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.66 
 
 
206 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.19 
 
 
390 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
477 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
238 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.45 
 
 
200 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.1 
 
 
212 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
262 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.08 
 
 
235 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.08 
 
 
235 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>