196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0334 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0334  methyltransferase type 11  100 
 
 		 272 aa  563  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.530164 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  58.49 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  58.49 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  43.91 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  43.22 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2600  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.48 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.34 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  32.52 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.91 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.85 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.19 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.84 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.98 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.93 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.33 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  32.48 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.34 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.63 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  35 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.66 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.79 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.08 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.1 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2192  hypothetical protein  41.94 
 
 		 65 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.88 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2479  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0780239  hitchhiker  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.06 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.21 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  33.63 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.35 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  31.85 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  31.82 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  32.32 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  28.68 
 
 		 870 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.97 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 442 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  23.13 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  31.96 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  26 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.04 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.04 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 733 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.64 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>