More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5476 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  25.79 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.34 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  33.12 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.87 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.85 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  34.58 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.92 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  30.17 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  27.72 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.85 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.07 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.7 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  28.32 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.36 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  41.57 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  30.28 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.62 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.45 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.91 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.13 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  33.54 
 
 		 629 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  22.32 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>