203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1388 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  100 
 
 		 477 aa  974    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  46.93 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  46.37 
 
 		 436 aa  181  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  42.8 
 
 		 351 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  43.89 
 
 		 306 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  45.65 
 
 		 272 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 272 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  38.53 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  40 
 
 		 1635 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  38.12 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1085 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  35.71 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  34.04 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 995 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.4 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  26.72 
 
 		 185 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.45 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  30.3 
 
 		 238 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.67 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.58 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.32 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 264 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 551 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 259 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 210 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 369 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  27.19 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.36 
 
 		 243 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 197 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32 
 
 		 244 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  31.12 
 
 		 248 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 222 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 263 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 196 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.86 
 
 		 258 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 276 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.16 
 
 		 209 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1094 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 215 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  26.36 
 
 		 233 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  26.53 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  27.38 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  34.88 
 
 		 201 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 229 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  29.94 
 
 		 200 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 226 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 239 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  26.21 
 
 		 207 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  32.04 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  32.04 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 261 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 243 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 634 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 208 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  33.64 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 282 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 240 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  30.53 
 
 		 246 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  30.53 
 
 		 246 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 280 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  30.14 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  30.49 
 
 		 201 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 218 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 234 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  26.21 
 
 		 207 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>