More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00198 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  59.93 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  31.01 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.72 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 581 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.22 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  28.08 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.82 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.8 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.93 
 
 		 541 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  30.94 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.94 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.78 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  31.54 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.08 
 
 		 558 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  32.35 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.3 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.97 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.25 
 
 		 541 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.84 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  27.09 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  28.89 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.11 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.73 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  34.85 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.61 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 220 aa  52.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  30.46 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.43 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 208 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.56 
 
 		 312 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 229 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.74 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.78 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.37 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.19 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  30.49 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.01 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.43 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.21 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>