155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1956 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  56.99 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  55.73 
 
 		 195 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  50.77 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  53.12 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  52.79 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  49.49 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  45.55 
 
 		 193 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  45.03 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  38.34 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  38.22 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  35.96 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  36.71 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  40.87 
 
 		 1287 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.31 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.31 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  36.96 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  32.72 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.39 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.39 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.99 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  34.85 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.81 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  32.04 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.21 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.82 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.58 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  29.45 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  32.58 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  34.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.77 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  34.31 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  30.77 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.87 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 		 345 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.66 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  29.71 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.05 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  26.46 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.1 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  24.04 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 279 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  29.26 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  33.64 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  38.1 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  24.53 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  30 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.12 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  28.15 
 
 		 283 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.03 
 
 		 311 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 406 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>