More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0252 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  28.05 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  30 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  35.66 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.5 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  35.47 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  33.6 
 
 		 502 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.59 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.59 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.19 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  33.64 
 
 		 387 aa  52.4  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.4 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.59 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  29.52 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.58 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.35 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.27 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.64 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.58 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.88 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.05 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.41 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.9 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  29.31 
 
 		 491 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.03 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2346  putative methyltransferase protein  33.98 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.183128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  28.83 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  40 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.48 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.58 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  31.71 
 
 		 120 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  37.18 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.97 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.58 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.23 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>