295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  60.87 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2617  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0195  hypothetical protein  33.2 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0147  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 		 4483 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4620  methyltransferase type 12  37.38 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.2 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  31.06 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 353 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0899  methyltransferase type 12  37.23 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 		 6999 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30 
 
 		 351 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.82 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.08 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1535  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.29 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  28.43 
 
 		 3207 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 340 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  33.94 
 
 		 7785 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2324  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.94 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  25.86 
 
 		 1287 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.42 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 327 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 422 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 441 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 354 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.94 
 
 		 395 aa  48.9  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.03 
 
 		 541 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  31.53 
 
 		 399 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 441 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.26 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  24.55 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.53 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  32.46 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.63 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  32.71 
 
 		 476 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  30.71 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  31.58 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.5 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  21.13 
 
 		 567 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 518 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>