155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0517 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  100 
 
 
338 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3454  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  39.29 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  27.3 
 
 
377 aa  55.8  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1536  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0048  SAM-dependent methyltransferases  26.32 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.54394  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0034  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0028  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  29.92 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1181  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1461  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.89569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  37.5 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0034  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.5 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2763  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 
245 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.59 
 
 
318 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  37.76 
 
 
317 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.27 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  28.4 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  24.86 
 
 
272 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.59 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
274 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31.43 
 
 
1287 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  33.98 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
246 aa  49.7  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.19 
 
 
434 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.73 
 
 
621 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.49 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.95 
 
 
213 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  26.75 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  39.08 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  28.33 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.58 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  31.82 
 
 
244 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  31.07 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.84 
 
 
244 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  40.79 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  30 
 
 
276 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  29.29 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.15 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
276 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  33.33 
 
 
325 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
216 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  34.88 
 
 
276 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.64 
 
 
295 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.5 
 
 
457 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  43.21 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.2 
 
 
238 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.62 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  41.33 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 
399 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 
252 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
195 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 
457 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
356 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1109  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.52 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165958  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.47 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.51 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.64 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  35.51 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  30.17 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0734  O-methyltransferase family 3  27.63 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.83 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.89 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  35.85 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.04 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.47 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2155  O-methyltransferase family 3  29.41 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261573  normal  0.370065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.73 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.93 
 
 
7541 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  28.74 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.47 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.69 
 
 
494 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  22.28 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.1 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.88 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.99 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>