94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3454 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3454  Methyltransferase type 12  100 
 
 
336 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  27.86 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  29.97 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
404 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
320 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  30.95 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  29.86 
 
 
364 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.9 
 
 
386 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.47 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
235 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  29.97 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  40 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  40.71 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  29.47 
 
 
475 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  31.71 
 
 
341 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
304 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.69 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  21.22 
 
 
351 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.69 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  31.71 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.82 
 
 
262 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0749  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltrans ferase  43.68 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  39.51 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  28.77 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  20.34 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  28.15 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  38.66 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  31.1 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  37 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.46 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  24.62 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.21 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  26.39 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  26.13 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  20 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  23.68 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  33.33 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  23.49 
 
 
220 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0118  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.454348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.05 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.31 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  33.67 
 
 
1914 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  23.43 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.39 
 
 
420 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  26.04 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.5 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  31.58 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  27.92 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  27.13 
 
 
201 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  22.95 
 
 
208 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
253 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  28.18 
 
 
419 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
221 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
1287 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  33.87 
 
 
416 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  27.34 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 
279 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  24.22 
 
 
250 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  28.57 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  25.33 
 
 
284 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  21.26 
 
 
351 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
275 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
229 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
211 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  26.45 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  25.33 
 
 
284 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.09 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>