80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2131 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  79.42 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  32.56 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  29.08 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  29.03 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  30.12 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  28.02 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  26 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  26.14 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  27.57 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  26.42 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  25.31 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  24.74 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  22.51 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.93 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  21.65 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  24.07 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  22.89 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  22.89 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  25.33 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  24.67 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  23.93 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  21.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.09 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  25.63 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  23.83 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  23.78 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  18.62 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  22.55 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  24.64 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  19.65 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  24.17 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.91 
 
 		 558 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  23.96 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  23.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  22.31 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  20.91 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  29.94 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  26.95 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.68 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  22.41 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  23.17 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.14 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  22.22 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.22 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  24.17 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  23.99 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  21.46 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  21.43 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 340 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  20.09 
 
 		 294 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  22.89 
 
 		 272 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>