169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2277 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  100 
 
 
230 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  40.27 
 
 
230 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  26.56 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  27.01 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.24 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  27.55 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.02 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  23.92 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  26.05 
 
 
291 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
267 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  24.1 
 
 
291 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.86 
 
 
285 aa  62  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
267 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.38 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  28.38 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  24.78 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  29.01 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  30.2 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  24.07 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.19 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  23.53 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  28.37 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  28.48 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  22.88 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  30.61 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.24 
 
 
268 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.38 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  24.17 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  24.74 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  24.16 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.7 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  25.51 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.7 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.23 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  23.5 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  23.5 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  23.5 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  27.14 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  23.48 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  28.79 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
278 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  23.04 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  23.42 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.68 
 
 
558 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  26.37 
 
 
325 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  25.9 
 
 
291 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  28.45 
 
 
247 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  28.45 
 
 
248 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  20.77 
 
 
292 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  23.08 
 
 
228 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  23.08 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  29.15 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  23.04 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  23.04 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  22.02 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  26.39 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  23.04 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.59 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.59 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  20.77 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  24.78 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  23.04 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  23.04 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  26.18 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  21.63 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.12 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  21.96 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.75 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.73 
 
 
293 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  26.96 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  24.81 
 
 
274 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  22.61 
 
 
295 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.29 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  24.81 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  23.23 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.17 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  25.56 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
315 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  22.22 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>