123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0081 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  48.85 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  46.15 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  44.23 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  46.59 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  46.03 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  42.53 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  33.6 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  29.06 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  28.63 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  30.12 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  30.45 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.1 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.74 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.43 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.43 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  25.72 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.54 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.54 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.54 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.54 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.54 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  27.5 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  30 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.41 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.63 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.67 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  25.38 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  24.64 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.65 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.63 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  27.89 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  22.66 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  26.73 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  22.66 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  24.11 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  28.32 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  22.47 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  27.54 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  30.63 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  27.95 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  28.35 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  24.18 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  24.67 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  29.38 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.34 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  24.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  25.64 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  27.42 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  23.26 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  25.95 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  24.66 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  28.22 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.51 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  28.89 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  24.23 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.08 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  24.89 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  24.23 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  21.34 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  28.28 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.09 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  21.3 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  25.64 
 
 		 289 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  20.85 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  22.37 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.75 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  26.07 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  22.65 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  23.81 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  25 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  22.27 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  22.01 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  23.12 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  25.49 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>