91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2455 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  100 
 
 
279 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  79.42 
 
 
274 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  33.08 
 
 
255 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  30.04 
 
 
268 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  29.85 
 
 
261 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  28.89 
 
 
260 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  28.36 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  27.2 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  28.25 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  26.64 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  26.23 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  26.98 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  26.6 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  26.5 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  24.37 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.41 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  24.66 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  22.43 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  25.63 
 
 
474 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  24.08 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  23.32 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  22.51 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  22.51 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  21.56 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  23.67 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  24.1 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  22.57 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.1 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.6 
 
 
269 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  21.43 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  24.26 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  24.89 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.06 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.06 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  24.43 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  24.26 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  23.76 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.74 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  23.39 
 
 
251 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  21.94 
 
 
309 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  22.99 
 
 
267 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  23.31 
 
 
283 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  25.75 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  22.29 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  24.26 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  20.71 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  21.46 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  25.16 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.24 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.24 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.24 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.24 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.24 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  23.1 
 
 
558 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  24.1 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  21.13 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  22.67 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.79 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  30 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.84 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  21.36 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  25.52 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  29.17 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  20.92 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  22 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  20.48 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  22.96 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.41 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  20.4 
 
 
230 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  31.48 
 
 
243 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  21.82 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>