210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16501 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  67.06 
 
 
256 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  65.87 
 
 
256 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  66.27 
 
 
252 aa  332  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.6 
 
 
251 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  35.6 
 
 
251 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  31.75 
 
 
251 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.76 
 
 
252 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  31.47 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  26.53 
 
 
254 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  24.12 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  28.5 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  28.5 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.98 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.8 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  21.07 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  21.6 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  19.42 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  22.82 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  24.65 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  24.65 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  24.65 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  24.65 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  24.65 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  23.11 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.18 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  24.37 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  24.42 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.19 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  23.72 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  21.36 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  22.17 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.19 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  21.18 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  22.67 
 
 
474 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  23.33 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  21.82 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  21.37 
 
 
309 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  21.62 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  30.11 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  20.93 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  20.47 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  20.29 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  21.58 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  21.83 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  21.83 
 
 
276 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  23.02 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  19.56 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  19.76 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  21.86 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  21.25 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  21.92 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  21.05 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  21.07 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  22.12 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  21.46 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  21.62 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  25.36 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  20.68 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.65 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  20.81 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.58 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  21.46 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  20.38 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  19.48 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.92 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  20.66 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  20.66 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  18.45 
 
 
269 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.87 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  20.25 
 
 
272 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  21.05 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  21.05 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 
255 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  21.46 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  21.05 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  21.05 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  21.05 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.58 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  20.66 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.12 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  20.62 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  19.87 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  19.3 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  36.08 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  23.91 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  24.85 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  21.6 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  28.66 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>