256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0615 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 
250 aa  518  1e-146  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 
474 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  27.32 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  36.54 
 
 
267 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.29 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  36.71 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.14 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  25.19 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.55 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.03 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  35.26 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.5 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  24.32 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.11 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  35.29 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  23.26 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  34.56 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.34 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.44 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  26.17 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.56 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.33 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.33 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.33 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.33 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.33 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  26.42 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  25.5 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  28.81 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  25.1 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.79 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  23.5 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  23.5 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.36 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  23.35 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  25.44 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  31.33 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.87 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.7 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.81 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  24.29 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  23.97 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  23.56 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.05 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  24.02 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  28.96 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  23.97 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  23.85 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  29.89 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.75 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.25 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  32.86 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.09 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  22.77 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
321 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  26.16 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  24.89 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
321 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  20.09 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  28.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.44 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.44 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.49 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.61 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  27.85 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  43.75 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.34 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
321 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.12 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  23.6 
 
 
263 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
279 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  31.03 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  27.95 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.03 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  22.52 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>