152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16601 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_16601  methylase  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  91.3 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  86.72 
 
 
256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  67.06 
 
 
252 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  29.48 
 
 
251 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.78 
 
 
252 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.8 
 
 
251 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  34.4 
 
 
251 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 
254 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  25.2 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.11 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.11 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  20.09 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  24.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  24.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  24.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  24.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  24.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  26.95 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  26.95 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.2 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  21.25 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  21.25 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  22.07 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  21.25 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.11 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.55 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  23.29 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  20.83 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  20.83 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  20.83 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  20.83 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  20.83 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.24 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  22.94 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  20.75 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  18.39 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  20.58 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  20.58 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  20.16 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  20.16 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  20.16 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.44 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  19.92 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  19.69 
 
 
295 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  19.63 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  18.5 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  19.92 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  26.29 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.44 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.55 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  20.16 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  20.91 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  19.23 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  19.7 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  20.6 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  19.28 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  22.18 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  22.27 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  24.06 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  18.64 
 
 
300 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  20 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  21.71 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  21.54 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  21.31 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  21.05 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  20.39 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  17.65 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  23.55 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  17.19 
 
 
474 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  21.54 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.93 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  19.75 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  20.1 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  21.63 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  20.54 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.84 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  18.45 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  19.71 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  20.91 
 
 
255 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.89 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.19 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  22.64 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  21.3 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.73 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  22.97 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  21.93 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  24 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  20.83 
 
 
281 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.33 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  22.32 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.43 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.38 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  21.46 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  17.67 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
331 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>