87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0084 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  29.06 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  25.1 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  34.93 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  26.27 
 
 		 260 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  28.05 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  27.19 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  33.04 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  25.99 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  30.34 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  23.5 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  22.46 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  25.37 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.16 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.16 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.16 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.16 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.16 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.62 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.72 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.72 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.57 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  21.26 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  21.26 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  23.56 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  22.22 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.14 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  22.51 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  22.27 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  20.95 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  20.53 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  21.08 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  25.98 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  19.31 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  20.29 
 
 		 272 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.81 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  24.5 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  22.54 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  23.96 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  25 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  19.3 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  18.67 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  23 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  22.91 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.08 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  20.93 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  24.22 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  23.24 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  18.41 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  21.71 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  18.61 
 
 		 291 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.96 
 
 		 259 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  20.61 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  20.09 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  20.75 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.76 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  19.57 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.24 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.85 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.42 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  25.85 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.48 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.02 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  18.79 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  19.57 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  20.44 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  25 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  22.05 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.73 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  22.05 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.22 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  19.12 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  26.61 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  21.7 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  18.03 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.77 
 
 		 256 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  22.67 
 
 		 294 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  19.46 
 
 		 267 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>