49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1385 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  48.68 
 
 
228 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  47.19 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  46.75 
 
 
228 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  27.73 
 
 
255 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 
260 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  27.78 
 
 
260 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 
261 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  25.59 
 
 
263 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  28.16 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  26.51 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  33.04 
 
 
229 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  23.75 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  27.41 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.71 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  30.46 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.82 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  25 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.87 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.87 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.87 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.87 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.87 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  24.07 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.57 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.57 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.66 
 
 
285 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.38 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.38 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.62 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  23.38 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.33 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  24.03 
 
 
312 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.1 
 
 
558 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  24.79 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  20.42 
 
 
291 aa  48.5  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  24.79 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  20 
 
 
271 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  21.36 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  23.18 
 
 
291 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  20.67 
 
 
292 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
280 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  22.22 
 
 
251 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  20 
 
 
268 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>