203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2455 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  50.79 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  50.97 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  47.08 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  43.46 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  42.53 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  35.29 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  30.8 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  30.38 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.57 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.57 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.83 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.46 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.46 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.09 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.46 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.72 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  26.14 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  24.6 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.34 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  24.77 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  24.77 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  23.87 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.5 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.1 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  24.07 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.1 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  28.12 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  23.75 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  25.29 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  22.5 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  24.72 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  23.31 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.22 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.22 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  27.8 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  27.88 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  24.52 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  24.5 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  21.84 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  26.22 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  26.12 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  24.31 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  21.46 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  26.12 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  26.12 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.75 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  25.94 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  25.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  25.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  26.32 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  21.61 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  25.94 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  25.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  25.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  25.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  25.12 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  26.99 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  28 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  28.4 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  25.76 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  28.93 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  25.83 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.85 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.64 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  27.95 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  21.65 
 
 		 309 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  25.27 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  25 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  26.71 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  27.91 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>