125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2062 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  40.27 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.56 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  27.36 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  26.92 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  23.53 
 
 		 290 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  22.33 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  23.58 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  26.74 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  28.29 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.01 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  22.6 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  22.6 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  19.57 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.23 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  22.18 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  26.11 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  24.22 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  23.74 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.89 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  26.67 
 
 		 312 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  23.93 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  29.8 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  26.63 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.87 
 
 		 558 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  25.69 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  26.21 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  23.27 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  22.78 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.23 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  22.81 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  20 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  25.66 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  21.95 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.65 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  22.63 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  20 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  24.39 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.37 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  22.77 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  27.16 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.73 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  24.39 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  25.21 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  25.21 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  25.66 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  25.83 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  21.79 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  22.45 
 
 		 294 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_42302  predicted protein  31.07 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  31.88 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  25.74 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  22.06 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  20.17 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  20.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  20.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  20.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  23.81 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  20.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  21.4 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  20.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  25.66 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  30.69 
 
 		 2012 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  26.15 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  25.15 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  25.66 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  22.61 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  22 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  20.86 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>