More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1625 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  42.67 
 
 
236 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  42.67 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
236 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  44.55 
 
 
222 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  29.88 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  28.27 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.06 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  27.16 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  30 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.91 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.39 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  30 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  26.23 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
202 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  28.47 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  33.09 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  27.5 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  26.09 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  35.42 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  30.94 
 
 
194 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  28.03 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.7 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  27.89 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  26.94 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
195 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  31.78 
 
 
298 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
207 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
149 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
200 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  27.75 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  30.77 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  28.33 
 
 
209 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.32 
 
 
215 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  32.14 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.29 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  30.19 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  30.1 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  27.86 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  28.16 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  30.94 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  28.16 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  32.76 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.94 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  28.16 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  30.19 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  30.19 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>