More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4758 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  100 
 
 		 264 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  74.05 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  64.62 
 
 		 255 aa  351  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  63.46 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  63.46 
 
 		 255 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  62.69 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  62.69 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  62.69 
 
 		 255 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  62.69 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  63.46 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  60.46 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  63.46 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  57.41 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  54.02 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  53.03 
 
 		 261 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  51.13 
 
 		 263 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  43.22 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  42.75 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  40.73 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  35.38 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  36 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  33.45 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  34.3 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  39.3 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  38.81 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  34.01 
 
 		 294 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  36.86 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.14 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  38.33 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32.78 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  32.04 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  30.24 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  43.65 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  29.5 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.5 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  30.3 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.5 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  29.12 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  29.12 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.75 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.97 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.97 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  33.93 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  33.93 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.64 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  30.3 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  36.11 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.73 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.75 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  35.19 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.78 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.88 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  25.11 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30.21 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  34.26 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  29.55 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>