More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  54.41 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  44.06 
 
 		 269 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  30.8 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  32.52 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  31.74 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  25.94 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.02 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  31.84 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  28.84 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  25.65 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  27.24 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  27.57 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  29.6 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  29.2 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  27.99 
 
 		 276 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.58 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  26.57 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.17 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  24.09 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  24.09 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  25.54 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.46 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.84 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.09 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.78 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.54 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  24.18 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.17 
 
 		 335 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  27.69 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.34 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.67 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  26.15 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.29 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>