More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3729 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  39.21 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  34.21 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  36.19 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  35.38 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  40.66 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  37.28 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  33.45 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  36.92 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  37.28 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  36.12 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  40.25 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  34.7 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  34.7 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  35.27 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  32.97 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  36.09 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  35.66 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  36.32 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  35.77 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  38.08 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  33.8 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  36.9 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  32.4 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  30.95 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  32.26 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  32.26 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  29.5 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  29.85 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  30.88 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  35.98 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  39.69 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.02 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.5 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.57 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  31.14 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  25.12 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  31.4 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.08 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.08 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.54 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  26.94 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.54 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.98 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  34.68 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.74 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  34.74 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  39.22 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.66 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  29.66 
 
 		 663 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.92 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.45 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.61 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.58 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40.6 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.9 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>