More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2436 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  64.53 
 
 
283 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  63.26 
 
 
286 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  62.99 
 
 
282 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  63.24 
 
 
276 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  59.92 
 
 
269 aa  298  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  59.77 
 
 
274 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  58.71 
 
 
265 aa  291  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  58.53 
 
 
316 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  58.53 
 
 
284 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  56.72 
 
 
304 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  55.39 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  56.86 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  57.54 
 
 
362 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  56.18 
 
 
266 aa  271  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  55.04 
 
 
276 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  53.82 
 
 
293 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  51.57 
 
 
299 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  55.6 
 
 
277 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  50.94 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  50.39 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  47.22 
 
 
300 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.58 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.36 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  28.57 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  25.1 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.1 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.1 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.69 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.16 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.71 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.71 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.6 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  29.89 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  29.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  29.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  29.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  29.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  29.89 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  29.89 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  32.66 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.36 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  31.11 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.98 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  43.88 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.21 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  43.88 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  42.86 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.02 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  25.86 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
225 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  43.88 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.82 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  40.2 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  42.86 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
252 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
352 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.44 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>