More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1227 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  100 
 
 
300 aa  613  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  62.03 
 
 
266 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.11 
 
 
278 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  57.99 
 
 
274 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  48.1 
 
 
304 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  51.75 
 
 
276 aa  254  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  49.03 
 
 
262 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  52.96 
 
 
265 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  51.16 
 
 
276 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  49.64 
 
 
293 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  52.47 
 
 
277 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  52.76 
 
 
286 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  50 
 
 
269 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  46.39 
 
 
316 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  48.66 
 
 
274 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  49.22 
 
 
269 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  48.25 
 
 
283 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  49.27 
 
 
299 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  45.8 
 
 
362 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.95 
 
 
282 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  45.39 
 
 
284 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  47.22 
 
 
268 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  26.41 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  32.96 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  48.98 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  32.96 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  32.96 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  32.96 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  32.96 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  32.2 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.73 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.19 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.88 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.34 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.27 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  40 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.79 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.8 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.49 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.24 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.24 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  43.62 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.71 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.13 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.01 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.05 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.01 
 
 
229 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.16 
 
 
230 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  26.94 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.65 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.24 
 
 
231 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  40.57 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
241 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
223 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.1 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.22 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 
228 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.01 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.94 
 
 
232 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 
228 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  26.02 
 
 
246 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  35.26 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  43.3 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.62 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.29 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.45 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  21.96 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.57 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>