138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2574 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  100 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  57.76 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  57.04 
 
 		 285 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  57.04 
 
 		 285 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  56.47 
 
 		 285 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  53.38 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  52.5 
 
 		 292 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  54.68 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  54.32 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  47.35 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  32.86 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  31.79 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  30.8 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  34.49 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  31.16 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  55.65 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  35.02 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  36.14 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  43.11 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.77 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  29.8 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  32.27 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  29.69 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  25.09 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  25.09 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  25.83 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  25.83 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  24 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  35.67 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  24.58 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  24.17 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  26.15 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  23.75 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  23.4 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  23.59 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 389 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.75 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.49 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  34.75 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.14 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  27 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>